日誌
變種冠狀病毒好可怕？多喝豆漿補充各種蛋白質，變種病毒應該就回復到變種之前狀態了 . ...
Mutually exclusive gene expression refers to the ability of an organism to select one member of a large, multicopy gene family for expression while simultaneously silencing all other members of the family.
相互排斥的基因表達是指生物體選擇一個大的多拷貝基因家族的一個成員進行表達，同時使該家族的所有其他成員沉默的能力。
Mutually exclusive expression of the var gene family contributes to antigenic variation and immune evasion in Plasmodium falciparum.
var 基因家族的互斥表達有助於惡性瘧原蟲的抗原變異和免疫逃避。
小結1：
所以病毒突變是基因互斥造成的。
透過基因定序後，研究團隊發現 Lambda 變體有 8 個新的突變位點。
Lambda 變體和 Alpha、 Beta、Gamma 病毒株一樣，都比原始病毒少了 Δ3675- 3677 基因序列。這段缺少的序列位在 ORF1a 基因片段，ORF1a 與病毒產生特定水解蛋白的功能有關
在感染力方面， Lambda 變體具有 6 個位點突變（G75V, T76I, L452Q, F490S, D614G, T859N）。其中 2 個（L452Q 與 F490S）位在病毒的受體結合區域（RBD），由於 RBD 是病毒初期感染宿主、結合其細胞表面的構造。F490S 突變會會造成宿主抗體的中和能力降低。
It displays a novel deletion and multiple nonsynonymous mutations in the Spike gene (Δ246-252, G75V, T76I, L452Q, F490S, T859N).
它在 Spike 基因（Δ246-252、G75V、T76I、L452Q、F490S、T859N）中顯示出一個新的缺失和多個非同義突變。
Reverse mutation, also called reversion, denotes any mutational process or mutation that restores the wild-type phenotype to cells already carrying a phenotype-altering forward mutation. Forward mutations confer a gene sequence and phenotype different from that conferred by the wild-type gene. True reversions restore the wild-type gene sequence, whereas pseudoreversions restore the wild-type phenotype by a compensating gene sequence change.
反向突變，也稱為逆轉，表示將野生型表型恢復到已經攜帶表型修正到突變之前的細胞的任何突變過程或突變。正向突變賦予與野生型基因不同的基因序列和表型。真回復恢復野生型基因序列，而假回復通過補償基因序列變化恢復野生型表型。
In some cases the revertant repressors contain same-site substitutions that are similar to the wild-type side-chain (e.g. Tyr22----Phe, Ser77----Thr).
在某些情況下，回復體阻遏物包含與野生型側鏈相似的相同位點替換（例如 Tyr22----Phe、Ser77----Thr）。
In other same-site revertants, a very different type of residue is introduced (e.g. Ser35----Leu, Gly48----Asn).
在其他相同位點回復突變體中，引入了非常不同類型的殘基（例如 Ser35----Leu、Gly48----Asn）。
Two of the second-site revertants, Glu34----Lys and Gly48----Ser, restore activity to more than one primary mutant.
兩個第二位點回復突變體 Glu34----Lys 和 Gly48----Ser 恢復了多個初級突變體的活性。
Both substitutions apparently increase the affinity of the repressor-operator interaction by introducing new contacts with operator DNA.
通過引入與操縱子 DNA 的新接觸，這兩種替換顯然都增加了阻遏物-操縱子相互作用的親和力。
These results suggest that reversion may be a generally applicable method for identifying sequence changes that increase the activity of a protein to greater than wild-type levels.
這些結果表明，回復可能是一種普遍適用的方法，用於識別將蛋白質活性增加到高於野生型水平的序列變化。
Arg319-Phe541(F490S)
正常來講應該要把上述變種病毒的突變基因胺基酸序列找出來，看看突變之前和突變之前的差別，是哪一個胺基酸被改變了。
如何對抗新冠狀病毒---高手高手高高手之章Part-IV(就這麼吃，保住小命吧。)
告訴我們：
COVID-19 的核衣殼具有 WPQIAQFAPS 的保守序列，作為活性位點。
分子相互作用研究表明，COVID-19 的蛋白酶模型具有 thr75(Threonine 蘇胺酸 親水性 )、arg141(Arginine 精胺酸 鹼性)、gln175(Glutamine 麩醯胺酸 親水性) 和 his176(Histidine 組胺酸 鹼性)作為潛在的藥物結合位點
關於上述的序列WPQIAQFAPS：
W：色胺酸(Tryptophan Trp 疏水性)
P：脯胺酸(Proline Pro 疏水性)
Q：麩醯胺酸(Glutamine Gln 親水性)
I：異白胺酸(Isoleucine Ile 疏水性)
A：丙胺酸(Alanine Ala 疏水性)
F：苯丙胺酸(Phenylalanine Phe 疏水性)
S：絲胺酸(Serine Ser 親水性)
Exchangeability (x1000) by source (row) and destination (column)[7]
按源（行）和目標（列）的可交換性 (x1000)[7]
Ala(丙胺酸) 301 His(組胺酸)
His(組胺酸) 301 Gln(麩醯胺酸)
Lys(離胺酸) 301 Leu(白胺酸)
小結2：
由於
COVID-19活性位點序列WPQIAQF【位置在301】
COVID-19 的蛋白酶模型具有his176(Histidine 組胺酸 鹼性)作為潛在的藥物結合位點
按源（行）和目標（列）的可交換性 (x1000)[7]
Ala(丙胺酸) 301 His(組胺酸)
所以
組胺酸應該是可以替換改變COVID-19活性位點序列
又
2011年~大概2012年我曾看過蘇胺酸可以抑制愛滋病毒的論文敘述，而愛滋病毒也和新冠病毒一樣是RNA病毒。
COVID-19 的蛋白酶模型具有 thr75(Threonine 蘇胺酸 親水性 )作為潛在的藥物結合位點
因此
蘇胺酸或上述的arg141(Arginine 精胺酸 鹼性)、gln175(Glutamine 麩醯胺酸 親水性)
應該也有能改變COVID-19活性位點序列的地方
小結2：
也許變種冠狀病毒的變種，和COVID-19 的核衣殼具有 WPQIAQFAPS 的保守序列作為活性位點也有關，可能是因為活性序列驅動了基因突變，所以重點應該還是在於滅掉冠狀病毒序列的活性。
總結以上：
建議按照以下來吃，滅掉變種冠狀病毒活性。
如何對抗新冠狀病毒---高手高手高高手之章Part-IV(就這麼吃，保住小命吧。)
告訴我們：
富含組氨酸的蔬菜：
大豆，扁豆，利馬豆，豌豆
富含蘇氨酸的蔬菜：
大豆，扁豆，海藻，螺旋藻，利馬豆
富含精氨酸的蔬菜：
大豆，大蒜，豌豆，扁豆，利馬豆
~~~
豆類，乳製品，小麥，白菜，甜菜，豆類，菠菜，芹菜，堅果和豆腐中都含有麩醯胺酸。
牛奶和奶製品：牛奶，酸奶，奶酪，尤其是乳清乾酪，是這種氨基酸最豐富的來源之一。
節錄自https://keeper107.pixnet.ten(的相反)/blog/post/117252360
~~~
蘇氨酸主要食物來源：發酵食品（穀物製品）、雞蛋、茼蒿、奶、花生、米、胡蘿蔔、葉菜類、番木瓜、苜蓿 等
節錄自https://baike.baidu.com/item/蘇氨酸(網址為簡體中文)
~~~
組氨酸存在於香蕉，葡萄，牛奶以及奶類製品中。
~~~
治療冠狀病毒感染患者的蛋白質Part-III(建議羊奶、牛奶)
治療冠狀病毒感染患者的蛋白質Part-II(建議芝麻豆漿、茶葉蛋、優酪乳、巧克力飲品)
單寧酸抑制新冠病毒活性的秘密(香蕉、葡萄、茶葉、漿果、紅莓)
~~~
所以由上可看出喝鮮奶、優酪乳是對抗病毒的很好的做法
